La théorie du Big Bang ? Tu veux parler de la théorie cosmologique "standard" ?
Elle souffre de nombreux défauts, mais pas ceux que tu cites, ceux-là n'en sont pas, on les résoud facilement.
Par contre, il y a le fait que dans un des modèles de Big Bang existant, l'univers a connu une expansion tellement rapide au début de son histoire, que les particules ne pouvaient pas communiquer entre elles : l'univers fut donc autiste au début.
Il y a de plus des problèmes liés à l'énergie et à l'entropie de l'univers, dans ce modèle. Logiquement, l'énergie de l'univers doit rester constante, et son entropie doit croître avec le temps, car l'univers est par définition un système isolé. Or ce n'est pas exactement le cas avec le modèle standard.
En fait, en dehors du modèle standard, il existe d'autres modèles, qui ont aussi leurs défauts, d'ailleurs.
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@Pion : Enfin quelqu'un qui réfléchit par lui-même !
Évidemment si l'on dit que l'Univers n'est contenu dans rien, cela n'a pas de sens de dire qu'il est en expansion, mais en fait on parle d'une expansion intrinsèque : i.e. les descriptions physiques s'accomodent d'une description où le rayon R de l'univers augmente. De même, parler d'instants "avant" le Big Bang est sans signification, car on est dans un modèle à plusieurs dimensions courbe où aucun point ne correspond au temps d'avant. Tout cela se comprend très bien avec des images « géométriques » mais qu'il est hors de question d'expliquer ici (manque de place). Enfin, des modèles autres que le Big Bang, il y en a, par exemple on peut expliquer le red shift par une "fatigue" des photons.